MolView是什么？

MolView是一款面向化学教学与研究的免费、开源、纯网页端的分子可视化工具，用户不需要安装任何插件或客户端就可以在浏览器中完成绘制 2D 结构→实时生成 3D 模型→一键分享”的完整工作流程，整个过程不到30秒。

MolView功能特点

  • 左右双栏：左边画 2D 结构，右边立刻显示对应的 3D 模型，两边同步更新。

  • 多种渲染方式：优先用 WebGL 加速（GLmol），不支持时自动切换到 Jmol 或 ChemDoodle，保证在各种设备上都能用。

  • 内置数据库：可直接查 PubChem、RCSB PDB 和 COD。输入名称、SMILES 或 InChI，几秒内就加载出 3D 结构。

  • 预测光谱：点一下就能看到分子的 ¹H/¹³C NMR、IR、MS 主要峰位，还能导出 JCAMP-DX 格式，适合做作业或出题。

  • 高清截图：支持导出 PNG 或 SVG，背景透明，分辨率从 2K 起，能直接放进 PPT、教材或在线考试系统。

  • 高级操作：通过 Jmol 控制台，可以算能量、看分子轨道、静电势、偶极矩等。

  • 一键分享：地址栏里的链接就是当前画面，别人点开就能看到一模一样的模型。也支持嵌入 Moodle、Canvas、Blackboard 等教学平台。

  • 开源可改：代码在 GitHub 上公开（LGPL 许可），学校或团队可以自己部署。用 10 行 Flask 代码就能搭一个本地化合物查询网站。

MolView常见用途

  • 课堂教学：讲苯环时，一边画一边展示 120° 键角；讲手性时，实时旋转模型帮助学生理解。

  • 生物化学：输入“1UBQ”就能从 PDB 调出泛素结构，切换显示方式看 α-螺旋和 β-折叠。

  • 实验替代：没有核磁仪？让学生画乙酰水杨酸，马上看到预测的 ¹H NMR 谱图，结合化学位移讲解。

  • 远程教学：老师截图加链接发到群里，学生点开就能自己旋转模型，不用注册。

  • 作业考试：在学习管理系统里嵌入 MolView，学生画完结构提交链接，系统自动记录结果。

  • 科研快速查看：课题组内部部署后，新合成的化合物几秒就能调出 3D 结构，截图写报告很方便。

MolView怎么用

  • 打开浏览器，访问 molview.org。

  • 画结构：

  • 左边工具栏点“苯环”模板，再点碳原子可以延长链；

  • 右键能改元素、加电荷、画立体键。

  • 也可以直接在顶部搜索框输入“aspirin”或 SMILES，回车后自动加载 3D 模型。

  • 看 3D：

  • 右边窗口会立刻显示球棍模型；

  • 鼠标拖动旋转，滚轮缩放；

  • 顶部可切换显示样式，比如范德华球、线框、ribbon 等。

  • 点“Spectra”，勾选 ¹H NMR 就能看到预测谱图，还能放大或导出 PNG。

  • 保存分享：

  • 点菜单 File → Export，可选 PNG、SVG、MOL、SDF、PDB、SMILES 等格式；

  • 地址栏的链接已经包含当前分子信息，复制发人就能复现画面。

  • MolView进阶用法

  • 接自己的数据库：只要提供一个返回 SMILES 和 3D 数据的 REST 接口，就能在 MolView 里搜索校内化合物。

  • 本地部署：官方给了一个叫 molview.py 的 Flask 示例，10 行代码就能把 CSV 和 SDF 文件变成可搜索的网页，适合毕业设计或小组共享。

  • 接入教学平台：支持 LTI 1.1，Moodle、Canvas、Blackboard 都能嵌入。学生点开就能答题，提交后系统自动处理。

  • 脚本控制：在 Jmol 控制台输入命令，比如 calculate polarSurfaceArea 能立刻算出极性表面积；rotate y 360 120 可生成 120 帧旋转动画，方便录微课。

MolView技术说明

  • 完全基于浏览器，支持 Chrome、Firefox、Safari 等主流浏览器。

  • 界面适配手机、平板和电脑。

  • 代码开源（GitHub: https://github.com/molview/molview），用 MIT 许可证发布。

  • 通过 API 自动连接 PubChem、ChemSpider 等数据库，数据实时加载。

常见问题

  • MolView支持哪些文件？

    可导入/导出 SDF、MOL、CIF、PDB、SMILES、InChI。Gaussian 的 log 文件也能拖进去，自动提取振动频率和轨道信息。

  • MolView国内访问慢怎么办？

    MolView官网在国内加载可能较慢。建议把代码克隆到校内服务器，1 核 CPU + 1GB 内存就能支持 50 人同时用。

  • MolView收费吗？

    所有公开功能永久免费。如果想用自己的私有数据库，只要遵守 LGPL 协议就行。

  • MolView和 PyMOL、Chem3D 有什么区别？

    PyMOL 和 Chem3D 更适合专业科研，功能深但上手难。MolView 强调“快”和“简单”，30 秒出图、零安装，适合教学和快速演示。三者互补，不是替代关系。

MolView 把画图、看 3D、查数据库这三件事合在一个网页里。过去需要 ChemDraw、PyMOL 和多个网站才能完成的工作，现在一条链接就搞定。它是化学老师、学生和需要快速分享分子结构的研究人员的好帮手。

MolView开源地址：https://github.com/molview/molview